Сергей Пускепалис родился 15 апреля 1966 года в Курске. Окончил Саратовское театральное училище (1985, курс Юрия Петровича Киселёва). В 2001 году окончил РАТИ (режиссерский курс Петра Фоменко). Ещё во время учёбы в РАТИ ставил спектакли в Самарском театре «Понедельник». После выпуска как режиссёр ставил спектакли в московских и Омском театрах. В 2003 году начал сниматься в кино. Заслуженный артист России (1999).